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巴斯夫助力科研团队,寻找有效成分对抗新冠病毒
发布时间:2020-06-16     作者:www.planteng.cn
摘要:巴斯夫开放其包含数百万条目的物质库,供科研团队免费使用。超级计算机Quriosity助力公共研究项目识别并优化潜力分子。

作为“‘手’护”行动的一部分,巴斯夫不仅捐赠了大量消毒剂和防护口罩,还在全球范围内为学术研究团体提供支持,帮助寻找合适的活性成分,用于治疗感染新冠肺炎的患者。巴斯夫生物科学研究平台总裁Peter Eckes博士表示“虽然我们没有药物活性成分研发业务,但巴斯夫在物质研究方面拥有超过150年的经验。这意味着我们拥有大量的相关知识和囊括多种活性成分的大型物质库。”巴斯夫还开发了自己的计算机程序,用于分子设计,并拥有自己的超级计算机QuriosityEckes补充道:“充分发挥我们强大的研究能力,为抗击新冠疫情贡献一份力量。”为此,巴斯夫正通过多种方式帮助寻找病毒解药。

为快速找到有效抑制新冠病毒的活性成分,世界各地的学术机构正通过细胞培养测试已批准药物的有效性,虽然这些药物已用于治疗其他病毒性疾病,但可能对新冠病毒作用有限,因此有必要寻找活性成分的改进衍生物。为此,巴斯夫研究人员对公司内部包含数百万种分子的物质库进行了计算机辅助搜索,以寻找类似的化合物,并最终确定了150种有希望的候选化合物。巴斯夫免费向各大学术工作团队提供这些化合物,并允许其用于研究,无需支付任何专利费。巴斯夫生物科学研究员Matthias Witschel博士说“多年来,我们一直在支持疟疾等传染病的药物学术研究。因此,‘手’护行动才能迅速调用我们早已建立的人脉和流程。

超级计算机Quriosity模拟活性分子

来自计算化学部的化学家们提出了第二种寻找活性成分的方法,即利用计算机领域知识。随后,他们得知一家生物技术公司PostEra正开展COVID-19 Moonshot项目,参与该项目的全球科学家自愿帮助寻找一种抑制剂,通过抑制新冠病毒必需的一种酶——病毒主蛋白酶,阻止病毒在人体内自我复制。巴斯夫研究人员也加入其中,共同寻找有效抑制剂,在巴斯夫内部开发的计算机程序和超级计算机Quriosity的帮助下设计出许多新型分子。最终,他们通过模拟找到了20个最适合主蛋白酶活性位点的分子,并将相关分子信息免费提供给该项目,作进一步研究。

巴斯夫数字生物科学研究部的计算化学主任Klaus-Jürgen Schleifer教授解释道:“然而,这些通过计算机模拟得来的分子,我们并不确定它们能否被合成,合成度有多高。”针对这一问题,巴斯夫研究人员也在尝试第三种寻找活性成分的方法:借助超级计算机,对所有候选化合物进行测试。这些化合物原则上可以由COVID-19 Moonshot项目的合约制造商之一合成。Schleifer说道:“可能的化合物多达12亿种,我们就其抑制新冠病毒主蛋白酶的潜力进行一一计算。”使用超级计算机计算的优势在于,所有可能的活性分子都可以快速合成,然后在实验中接受测试。巴斯夫将通过COVID-19 Moonshot项目公开这些结果。

Eckes表示:“非常高兴可以发挥我们在化学方面的特殊专长支持药物活性成分研究,并为学术研究团队提供真实和虚拟的活性分子。这或许有助于早日研发出抗新冠药物。”

帮助学术研究团体寻找抗新冠活性成分是巴斯夫“‘手’护”行动的众多举措之一。在全球范围内,巴斯夫计划投入总额超过1亿欧元的抗疫资金。